Die zum Geschäftsbereich des Bundesministeriums der Finanzen gehörende Generalzolldirektion (GZD) wurde zum 1. Januar 2016 als Ergebnis einer umfassenden Strukturreform zur Neuordnung der Zollverwaltung gegründet und ist für die operative Steuerung der Zollverwaltung zuständig. Ihre Aufgaben wurden zuvor vom Bundesministerium der Finanzen, den Bundesfinanzdirektionen, vom Zollkriminalamt und vom Bildungs- und Wissenschaftszentrum der Bundesfinanzverwaltung wahrgenommen. Die GZD gliedert sich in Direktionen an den Dienstorten Bonn, Potsdam, Neustadt an der Weinstraße, Hamburg, Nürnberg, Köln und Münster, die in Unterabteilungen und Referate untergliedert sind. Der GZD steht ein Präsident vor, der von einem Leitungstab mit übergreifenden Aufgaben unterstützt wird. Zu den Fachaufgaben der GZD gehören

1) Allgemeines Steuerrecht und Kontrollen (Direktion III)

2) Verbrauchsteuer-, Verkehrsteuerrecht und Prüfungsdienst (Direktion IV)

3) Allgemeines Zollrecht (Direktion V)

4) Recht des grenzüberschreitenden Warenverkehrs/Besonderes Zollrecht (Direktion VI)

5) Finanzkontrolle/Schwarzarbeit (Direktion VII)

6) das Zollkriminalamt (Direktion VIII) sowie das

7) Bildungs- und Wissenschaftszentrum (BWZ).